Nhà Sinh Học Trẻ

Diễn Đàn của những Bạn Trẻ yêu thích Sinh Học
Hôm nay, Thứ ba 22/07/14 4:15 pm

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Nội quy chuyên mục


- Những chủ đề mà tác giả không biết sắp vào đâu có thể đặt tạm tại đây. Sau đó, chúng sẽ được người quản lý chuyển đến các chuyên mục liên quan gần nhất.
- Không gởi bài xin tài liệu trong chuyên mục này (xem chuyên mục "Tài liệu theo yêu cầu")



Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 10 bài viết ] 
Người gửi Nội dung
 Tiêu đề bài viết: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ tư 24/11/10 9:23 am 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ hai 22/11/10 9:43 am
Bài viết: 13
Anh chị nào rành về anh văn chuyên ngành dịch dùm em đoạn này nhé, em cảm ơn nhiều:
Primary growth curve-The plot of Fluorescence vs cycle number. A real time growth curve should have four distinct phases: baseline, exponential, log-linear and plateau. The increase in fluorescence is proportional to the amount of amplicon generated.

Thuật ngữ sau 4 pha riêng biệt em không biết dịch sao cho sát với chuyên ngành, mong anh chị giúp dùm. Thanks.


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ bảy 27/11/10 2:14 am 
Ngoại tuyến
virus
virus

Ngày tham gia: Thứ sáu 19/11/10 5:21 am
Bài viết: 16
chào bạn
Primary growth curve: trong vi sinh vật dịch là "đường cong sinh trưởng sơ cấp"; trong real-time PCR dịch là "đường cong khuyếch đại đầu tiên".
The plot of Fluorescence: tín hiệu huỳnh quang
Cycle number: số chu kì.
A real time growth curve should have four distinct phases: baseline, exponential, log-linear and plateau: một đường cong khuếch đại trong rt pcr gồm có 4 giai đoạn (pha): đường nền, giai đoạn lũy thừa (chú ý giai đoạn này tăng tuyến tính) và giai đoạn bình nguyên hay ổn định, và giai đoạn ủ trước đường nền mà bạn không viết, bạn đọc tài liệu nào chứ exponential, log-linear là giai đoạn lũy thừa đó.
The increase in fluorescence is proportional to the amount of amplicon generated: sự tăng tính hiệu huỳnh quang tỷ lệ vởi tổng số bản sao được tạo ra.
Baseline: đường nền
Basal cycle: chu kì nền chứ không phải baseline như bạn đánh trên đó là nghĩa ko phải là chu kì mà là đường nền thôi, qua ngưỡng đường nên thì tín hiệu mới xuất hiện.
chúc bạn hoc giỏi


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ tư 01/12/10 9:05 am 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ hai 22/11/10 9:43 am
Bài viết: 13
trần văn giang đã viết:
chào bạn
Primary growth curve: trong vi sinh vật dịch là "đường cong sinh trưởng sơ cấp"; trong real-time PCR dịch là "đường cong khuyếch đại đầu tiên".
The plot of Fluorescence: tín hiệu huỳnh quang
Cycle number: số chu kì.
A real time growth curve should have four distinct phases: baseline, exponential, log-linear and plateau: một đường cong khuếch đại trong rt pcr gồm có 4 giai đoạn (pha): đường nền, giai đoạn lũy thừa (chú ý giai đoạn này tăng tuyến tính) và giai đoạn bình nguyên hay ổn định, và giai đoạn ủ trước đường nền mà bạn không viết, bạn đọc tài liệu nào chứ exponential, log-linear là giai đoạn lũy thừa đó.
The increase in fluorescence is proportional to the amount of amplicon generated: sự tăng tính hiệu huỳnh quang tỷ lệ vởi tổng số bản sao được tạo ra.
Baseline: đường nền
Basal cycle: chu kì nền chứ không phải baseline như bạn đánh trên đó là nghĩa ko phải là chu kì mà là đường nền thôi, qua ngưỡng đường nên thì tín hiệu mới xuất hiện.
chúc bạn hoc giỏi

NhutNguyen đã viết:
Anh chị nào rành về anh văn chuyên ngành dịch dùm em đoạn này nhé, em cảm ơn nhiều:
Primary growth curve-The plot of Fluorescence vs cycle number. A real time growth curve should have four distinct phases: baseline, exponential, log-linear and plateau. The increase in fluorescence is proportional to the amount of amplicon generated.

Thuật ngữ sau 4 pha riêng biệt em không biết dịch sao cho sát với chuyên ngành, mong anh chị giúp dùm. Thanks.


Ở chỗ em exponential được xem là thời kỳ bùng nổ khuyếch đại đó. Vì em tìm hiểu về realtime virus trên động vật nên có hơi khác tí.

Anh xem trích dẫn này và dịch dùm em nhé
A normal amplification curve has a:
1. Baseline
2. Exponential (geometric) phase.
3. Linear phase
4. Plateau phase.

A "normal" curve has a sigmoidal shape with a flat baseline, sharp increase in fluorescence in the exponential phase, non-exponential increase in the linear phase. Experimental error (pipetting error, etc.) and specimen abnormalities can produce data that deviate significantly from normal amplification curves. atypical data can cause software algorithms to generate incorrect baseline and threshold values.

Anh làm bên realtime mà bên lĩnh vực nào? Cách đọc mẫu dương tính ra sao và anh đang sài máy model nao?


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ năm 02/12/10 5:46 am 
Ngoại tuyến
virus
virus

Ngày tham gia: Thứ sáu 19/11/10 5:21 am
Bài viết: 16
A normal amplification curve has a: 1 đường cong khuếch đại bình thường có
1. Baseline : gia đoạn ủ hay giai đoạn đường nền, nghĩa là nó nằm dứoi cái đường nền trên đô thị
2. Exponential (geometric) phase.: pha hàm số mũ hay cấp cố nhân, exponential ở đây không dịch là bùng nổ như bạn đâu
3. Linear phase: pha tuýen tính, trong pha này hàm lượng ADN (số chu kì) và chất hquang tănt tuến tính
4. Plateau phase.: ha bình nguyên, nghia là không tăng lên nữa.
đối tượng gì thì gì mà nguyên lý của máy là nó vẫn thế, chỉ khác cách khai thác mục đích ncuu, cách dùng mẫu dò nào...
mình dùng máy lightcycler.
một đường cong binh thường có dạng xích ma với đường nền thẳng, tín hiệu huỳnh quang tăng đột ngột trong pha lũy thừa ko tăng cấp số nhân trong pha tuyến tính. thí nghiệm bị sai như thao tác với pipet.. hoặc mẫu bất thường có thể làm sai lệch dữ liệu và tín hiệu từ đường cong bình thường. Dữ liệu không điển hình có thể làm cho các thuật toán trong phần mềm dẫn đến không chính xác trong đường nền và chu kì ngưỡng.
anh khong hiểu câu hỏi cahc đọc mẫu dương tính là mẫu gì với mẫu gì của virus


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ năm 02/12/10 8:33 am 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ hai 22/11/10 9:43 am
Bài viết: 13
trần văn giang đã viết:
A normal amplification curve has a: 1 đường cong khuếch đại bình thường có
1. Baseline : gia đoạn ủ hay giai đoạn đường nền, nghĩa là nó nằm dứoi cái đường nền trên đô thị
2. Exponential (geometric) phase.: pha hàm số mũ hay cấp cố nhân, exponential ở đây không dịch là bùng nổ như bạn đâu
3. Linear phase: pha tuýen tính, trong pha này hàm lượng ADN (số chu kì) và chất hquang tănt tuến tính
4. Plateau phase.: ha bình nguyên, nghia là không tăng lên nữa.
đối tượng gì thì gì mà nguyên lý của máy là nó vẫn thế, chỉ khác cách khai thác mục đích ncuu, cách dùng mẫu dò nào...
mình dùng máy lightcycler.
một đường cong binh thường có dạng xích ma với đường nền thẳng, tín hiệu huỳnh quang tăng đột ngột trong pha lũy thừa ko tăng cấp số nhân trong pha tuyến tính. thí nghiệm bị sai như thao tác với pipet.. hoặc mẫu bất thường có thể làm sai lệch dữ liệu và tín hiệu từ đường cong bình thường. Dữ liệu không điển hình có thể làm cho các thuật toán trong phần mềm dẫn đến không chính xác trong đường nền và chu kì ngưỡng.
anh khong hiểu câu hỏi cahc đọc mẫu dương tính là mẫu gì với mẫu gì của virus



Thanks sư huynh! Tại vì sau khi máy chạy xong chương trình thì sẽ có những mẫu dương tính, tuy nhiên là đường cong khuyếch đại sẽ cắt đường baseline như thế nào? vì máy iQ5 biorad thường sài chế độ auto adjust nhưng không chính xác, còn ở máy Smart cycler thì dù đường amplification có là 1500 hay 500 gì thì nó cũng set baseline là 30 hết nhưng lại cho kết quả chuẩn không như Biorad iQ5 chạy auto luôn cho kết quả thấp hơn (Ct lớn hơn). Ý em hỏi là có cách tính nào để mình set cái baseline đọc kết quả chính xác hơn không vì có những đường khuyếch đại có chiều cao thấp và cao khác nhau. Khổ quá vì trang web không có chức năng chèn ảnh minh họa nên nói vậy cũng thật khó hiểu??????


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ năm 02/12/10 5:36 pm 
Ngoại tuyến
Chuyên gia
Chuyên gia
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Chủ nhật 06/03/05 11:25 pm
Bài viết: 760
Plateau phase: thường dịch là "pha ổn định" khi nói về đồ thị


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ hai 06/12/10 9:50 am 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ hai 22/11/10 9:43 am
Bài viết: 13
SV đã viết:
Plateau phase: thường dịch là "pha ổn định" khi nói về đồ thị



Mấy anh chị nào cứng nghề xin dịch giúp dùm em đoạn này nó bị Sựt quá:

"Lyophilized AIV rRT-PCR matrix reagent beads have been repared by Ceipheid (Sunnyvale, CA) for use with this matrix assay. Reagent beads can be precured directly from Ceipheid, Sunnyvale, CA. Each bead is sufficient for four 25ul reactions."

nhiều quá mình đánh máy hơi bị mỏi tay. Làm ơn giúp dùm mấy thuật ngữ này dùm em. Hellp!


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ hai 06/12/10 10:54 am 
Ngoại tuyến
bacterium
bacterium
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ ba 13/09/05 10:24 am
Bài viết: 35
Đến từ: Sở KHCN Long An
Để xem những kết quả có tín hiệu yếu hơn những tín hiệu khác, NhutNguyen nên xem từng mẫu yếu riêng lẻ, nếu có standard thì so mẫu đó với standard. Đừng chọn cùng lúc nhiều mẫu vì khi đó máy sẽ có sự so sánh độ lớn của các tín hiệu, tín hiệu yếu sẽ rất khó xem xét trên biểu đồ.
Thân chào./.

_________________
Làm gì cũng phải có tâm
SV ĐH KHTN TPHCM


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ hai 06/12/10 12:22 pm 
Ngoại tuyến
coaserva
coaserva

Ngày tham gia: Thứ hai 22/11/10 9:43 am
Bài viết: 13
dacudra đã viết:
Để xem những kết quả có tín hiệu yếu hơn những tín hiệu khác, NhutNguyen nên xem từng mẫu yếu riêng lẻ, nếu có standard thì so mẫu đó với standard. Đừng chọn cùng lúc nhiều mẫu vì khi đó máy sẽ có sự so sánh độ lớn của các tín hiệu, tín hiệu yếu sẽ rất khó xem xét trên biểu đồ.
Thân chào./.


Thanks kiu sư huynh, vấn đề này em cũng đã xem xét rùi. Tuy nhiên cách set baseline cho phù hợp vẫn còn là điều khó nói. hic.


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
 Tiêu đề bài viết: Re: Primary growth curve nghĩa là gì?
Gửi bàiĐã gửi: Thứ tư 29/12/10 9:33 pm 
Ngoại tuyến
virus
virus
Hình đại diện của thành viên

Ngày tham gia: Thứ hai 24/12/07 10:35 pm
Bài viết: 16
NhutNguyen đã viết:
dacudra đã viết:
Để xem những kết quả có tín hiệu yếu hơn những tín hiệu khác, NhutNguyen nên xem từng mẫu yếu riêng lẻ, nếu có standard thì so mẫu đó với standard. Đừng chọn cùng lúc nhiều mẫu vì khi đó máy sẽ có sự so sánh độ lớn của các tín hiệu, tín hiệu yếu sẽ rất khó xem xét trên biểu đồ.
Thân chào./.


Thanks kiu sư huynh, vấn đề này em cũng đã xem xét rùi. Tuy nhiên cách set baseline cho phù hợp vẫn còn là điều khó nói. hic.


Hi all,

Chức năng tự động tính toán baseline theo kinh nghiem của em đôi khi cho kết quả kết quả không đáng tin cậy, đối với những trường hợp sử dụng huỳnh quang nền và không dùng huỳnh quang nền thì cách tính baseline sẽ như thế nào? Anh/chị nào có kinh nghiệm vui lòng cho mọi người và em cùng biết với!

Thanks,
VTV


Đầu trang
 Xem thông tin cá nhân  
 
Hiển thị những bài viết cách đây:  Sắp xếp theo  
Tạo chủ đề mới Gửi bài trả lời  [ 10 bài viết ] 

Thời gian được tính theo giờ UTC + 7 Giờ


Ai đang trực tuyến?

Đang xem chuyên mục này: Không có thành viên nào đang trực tuyến1 khách


Bạn không thể tạo chủ đề mới trong chuyên mục này.
Bạn không thể trả lời bài viết trong chuyên mục này.
Bạn không thể sửa những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể xoá những bài viết của mình trong chuyên mục này.
Bạn không thể gửi tập tin đính kèm trong chuyên mục này.

Tìm kiếm với từ khoá:
Chuyển đến:  
POWERED_BY
Vietnamese language pack for phpBB 3.0.x download and support.